Alors je vois 2 choses : votre pédiatre a éliminé le reflux mais il arrive parfois que le corps médical soit un peu mal informé sur cette question. S'il y a eu un changement d'alimentation, vous pourriez essayer de "revenir en arrière" pour voir ce que ça donne dans un premier temps (si cela revient à lui donner un peu plus à manger au repas, sur une courte période ça ne devrait pas déranger sa croissance). Si les cris ressemblent à des cris de douleur, à 2h du repas c'est tout de même probable que la digestion soit en question, RGO ou autre.
Une fois cette cause éliminée, vous pouvez aussi essayer ceci : répondre rapidement au 1er cri, expliquer le message que vous souhaitez transmettre (à vous de décider comment le formuler : "tu es bien dans ton lit, maintenant c'est l'h de dormir, sois serein, tu n'as pas à t'inquiéter nous sommes à côté...") jusqu'à ce qu'il se calme, puis, pleurs ou pas pleurs quand vous le reposez, quittez la pièce, appliquez le 5-10-15 toujours avec le même message, en le touchant de moins en moins. De jour en jour vous devriez constater une amélioration. Ne pas hésiter à répéter le message en journée sur votre besoin de sommeil et le sien.
Bon courage!